Om de är samspelta och lirar bra, varför inte spela in flera samtidigt med ett stereopar en bit ifrån bara? Kanske spotmick om det är något som har svårt att gå fram, för solospel eller liknande + tidskompensera ev. närmickar så de ligger i fas med stereoparet isf.
Alt. med en mick på varje instrument om det är viktigt med egna kanaler. Om instrumenten är någorlunda jämnstarka i volym borde det inte vara några problem att få lagom separation, oavsett om det är två elgitarrer eller två näsflöjter. Men det förutsätter ju visst utrymme i inspelningsrummet. Sikta på 3x avståndet mellan mikrofonerna mot avstånd instrument-->mick.
Annars om det är spår för spår pålägg som gäller tänk på att inte gå för nära, speciellt fiolen. 1-1,5m snett ovanifrån brukar kunna funka.